Wraz z powołaniem do istnienia Uniwersytetu Śląskiego w Katowicach, rozpoczęto wydawanie czasopisma „Śląskie Studia Historyczno-Teologiczne”. Wśród monografii z lat siedemdziesiątych, osiemdziesiątych i dziewięćdziesiątych znalazły się znane i cenione prace m.in. ks. R. Sobańskiego, o. A. Jankowskiego, ks. A. Zuberbiera, ks. M. Ruseckiego, bp. K. Romaniuka, ks. D. Olszewskiego, ks. J. Cudy, ks. J. Szymika.

Wiele publikowanych prac naukowych otrzymało nagrody wydawców i wyróżnienia naukowe, jak nagrodę „Feniks” 2011 dla serii Studia Antiquitatis Christianae. Series Nova oraz „Feniks” 2016 i tytuł „Książka Roku” 2017 Komitetu Nauk Teologicznych PAN w dziedzinie nauk teologicznych za trylogię ks. prof. J. Szymika Theologia benedicta.

Profil tematycznego działu naukowego Wydawnictwa określa współpraca z Wydziałem Teologicznym Uniwersytetu Śląskiego w Katowicach. Wydawnictwo publikuje monografie i czasopisma z zakresu teologii, filozofii, historii Kościoła, historii regionu, prawa kanonicznego oraz nauk o rodzinie. Prace z zakresu filologii i pedagogiki współtworzą profil Wydawnictwa, w takiej mierze, w jakiej wpisują się w tematykę dialogu Kościoła ze światem. Na promowaniu tego dialogu Wydawnictwu bardzo zależy.

Nad poziomem merytorycznym prac czuwa Rada Wydawnictw Naukowych Księgarni św. Jacka  i powoływani przez nią recenzenci.

Członkowie Rady:
ks. dr hab. Antoni Bartoszek
ks. dr hab. Jacek Kempa
ks. dr Dawid Ledwoń
ks. prof. dr hab. Artur Malina
ks. prof. dr hab. Jerzy Myszor
ks. dr hab. Antoni Reginek
ks. dr hab. Leszek Szewczyk
p. prof. Krzysztof Wieczorek
ks. dr Arkadiusz Wuwer