Od wielu lat Księgarnia św. Jacka jest obecna na rynku książkowym jako uznany wydawca, o czym świadczą również otrzymane nagrody i wyróżnienia.
Książki wydawane w naszej Księgarni były kilkakrotnie nagradzane m.in. statuetką FENIKSA – prestiżową nagrodą przyznawaną przez Stowarzyszenie Wydawców Katolickich ‒ wręczaną podczas Targów Wydawców Katolickich. Poniżej znajduje się lista FENIKSÓW otrzymanych przez Księgarnię w latach 1999–2017:
Kategoria: autor zagraniczny
Vittorio Messori, Czarne karty Kościoła
*
Kategoria: publicystyka i popularyzacja
Kościół XX wieku. Rozmowy Ewy K. Czaczkowskiej
*
Kategoria: autor zagraniczny
Pierre Blet SJ, Pius XII i druga wojna światowa w tajnych archiwach watykańskich
*
Kategoria: publicystyka religijna
ks. Jerzy Szymik, Alina Petrowa-Wasilewicz, Jak Ślązak z Bułgarem czyli patchwork prowincjonalny
*
Kategoria: książka dla dzieci
Barbara i Marcel Trojan, DEKALOG w tekstach, w piosenkach, w obrazach
Kategoria: literacka
ks. prof. Jerzy Szymik , „Cierpliwość Boga”. 66 wierszy 2003-2006
*
Kategoria: seria wydawnicza
Studia Antiquitates Christianae. Series Nova
*
Kategoria: nauki kościelne
ks. prof. Jerzy Szymik, Theologia benedicta. Tomy 1‒3
*
Dla: ks. prof. Wincentego Myszora
Uhonorowanie imponującego dorobku naukowego i przekładowego (Nagroda pośmiertna)
Dla: ks. prof. dra hab. Jerzego Szymika
Złoty Feniks za działalność naukową i pisarską.
W roku 2019 Księgarnia św. Jacka otrzymała podczas 23. Międzynarodowych Targów Książki od Olsztyńskich Zakładów Graficznych OZGRAF S.A wyróżnienie w kategorii książka religijna (jednej z siedmiu kategorii, w których przyznawano wyróżnienia) za serię „Biblia Impulsy” oraz Grand Prix za książkę Krzyż i Chwała.
